La basilica di S.Clemente è situata a circa trecento metri dal Colosseo, sulla strada in lieve salita che tra Colle Oppio (Domus Aurea) e il Celio porta a San Giovanni in Laterano. Prende il nome da S.Clemente Papa, terzo successore di S.Pietro, morto intorno all'anno 100 d.C.

La sua commemorazione ricorre il 23 novembre, secondo la data che troviamo nel martirologio italiano del V secolo noto sotto il nome di Martirologio Geronimiano.

L'odierna basilica viene considerata l'originaria fino al 1857, anno in cui il Priore, Padre Joseph Mulloly, inizia degli scavi nei sotterranei. Da qui vengono riportate alla luce delle notizie incredibili, difatti venne scoperta la basilica originaria del IV secolo, immediatamente al di sotto della stessa; continuando gli scavi archeologici si sono conosciute costruzioni ancora più antiche, risalenti al I secolo. L'evento più significativo viene datato negli anni 1912 - 1914 in cui, per merito del Padre Louis Nolan, che fece costruire un canale di scolo tra San Clemente e il Colosseo, si conobbe un quarto strato della basilica, appartenente al periodo dell'incendio di Nerone della Domus Aurea nel 64 d.C.